"L'Institut" nous plonge dans les mystères d'une organisation secrète qui enlève des enfants dotés de pouvoirs psychiques et les utilise pour des missions ultrasecrètes dans le but de "sauver le monde". Luke Ellis, un surdoué qui a le pouvoir de télékinésie, est le dernier kidnappé. Il est déterminé à s'échapper avec ses nouveaux amis et espère trouver un moyen de faire tomber l'organisation.